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徐夫子
徐夫子，中国3D武侠动画《秦时明月》系列中的男性角色。
枯瘦老者，墨家统领之一，人称“剑之尊者”，著名的铸剑大师，他手中铸造出的宝剑，都是剑客们梦寐以求的神兵利刃，精通采五金融和青铜的冶剑技术，名剑“水寒”就是出自他的手中。 -
班大师
班大师，中国3D武侠动画《秦时明月》系列中的原创男性角色。
墨子后裔，老者。墨家统领中地位最高者之一，非攻机关术专家，以善于发明各种机关而闻名。木匠出身，由于幼年的一次意外导致失去一条手臂，从此开始钻研和制造各种机关。看起来是个糊涂的老头儿，实际上在机关术上有着天人一般的精湛技艺。 -
燕丹
燕丹，中国3D武侠动画《秦时明月》系列中的男性角色，原型为历史上的战国末期燕国太子燕丹。
姬姓，燕氏，名丹。燕王喜的儿子，阴阳家焱妃的丈夫，高月公主的父亲。本为燕国太子，因刺秦计划失败而携带妻女逃亡。后故作被卫庄杀死，让世人皆以为燕丹已亡。从此隐秘王族身份，以墨家巨子的身份活动，世上没有几人知道他的真实身份。
多年后，燕丹在墨家机关城再次与卫庄展开交锋，并最终公开了自己的真实身份。但因身中阴阳家的六魂恐咒，无法医治，燕丹将一生内力及巨子之位传给了荆天明，最终选择与崩塌的墨家机关城一起陨落。 -
六指黑侠
六指黑侠，中国3D武侠动画《秦时明月》系列中的原创男性角色。
燕丹的前任的墨家巨子。其左手（第2部画面中实际为右手）上有六根手指，又喜着黑色斗篷，故被江湖人称“六指黑侠”。生前叱咤风云，连阴阳家五大长老联手都没有拿下，但后来却突然失踪不见，消失于众人的视野，若干年后竟被发现死在墨家禁地的石牢中。江湖传闻称其被卫庄杀死，实际是死于阴阳家东君焱妃的六魂恐咒。配音演员： 郭易峰
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卫庄
卫庄，中国3D武侠动画《秦时明月》系列及其姐妹篇《天行九歌》中的男性角色，原型为温世仁原著台湾武侠小说《秦时明月》系列中的卫庄。
韩国人，自小就因不明原因在韩国王宫中生活。纵横家，鬼谷横剑术传人，浑身充满邪气与霸气，武功深不可测，是霸气与力量型的剑客。起初目标为击败师哥盖聂，证明自己的实力，继承鬼谷绝学，为此他一度与秦朝合作，在墨家机关城与盖聂一战，实力难分伯仲。后在韩国友人张良的劝解下，与盖聂、墨家等反秦势力达成暂时的利益合作关系。
同时也是“流沙”组织的现任最高首领。一直在暗中调查昔日好友——“流沙”创立者韩非的死因。 -
盖聂
盖聂（gě niè），中国3D武侠动画《秦时明月》系列中的主要男性角色，以温世仁原著小说《秦时明月》系列中角色盖聂为直接原型，以中国战国末年剑术家盖聂为根本原型。
气质从容淡定，处事冷静。师出鬼谷，剑术出神入化，被称为天下第一剑客，在江湖上享有“剑圣”的名号，但是却为了对逝去朋友荆轲的承诺，出人意外地从秦国叛逃，带着故人荆轲之子荆天明，亡命天涯。佩名剑“渊虹”。渊虹剑折断后改用自削的木剑。在张良的调解下，与流沙达成暂时的合作关系。 -
鬼谷子
鬼谷子，是中国3D武侠动画《秦时明月》系列中，根据中国春秋战国时期思想家鬼谷子衍生出的剧情设定，是历代纵横家首领的称号。截止至动画第5部上映，仅提及3位鬼谷子。
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石兰
石兰，中国3D武侠动画《秦时明月》系列中的女性角色，首次登场于动画第2部第18集的尾声，后在动画第3部第23集首次正式登场，并从动画第4部起正式被官方定位为故事的第二女主角。
表面上是庖丁在桑海的“有间客栈”中打杂的小伙计，外表柔弱，唯唯诺诺，总是无害的、默默关注着周遭所发生的一切。其真实身份是蜀山的虞渊护卫之一，本名小虞，背负着神秘而重要的任务，女扮男装在桑海的“有间客栈”中做小伙计，其实是为了打探蜃楼的情报而来。有时化身为月下的夜行人，如精灵一般，身轻如燕，身手矫捷，有一双冰冷的眼眸。配音演员： 洪海天
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项少羽
项少羽，中国3D武侠动画《秦时明月》系列中的第二男主角，以历史上的西楚霸王项羽为根本原型。
楚将项燕之孙，被秦国用重金悬赏的楚国项氏一族少主。天赋异禀，有千斤拔鼎之神力。智勇双全，年纪虽小，临阵决敌却已有大将之风，为人仗义。后在桑海与蜀山少女石兰互生好感（动画官网第4部人物关系图表明）。 -
高月
高月/姬如千泷，中国3D武侠动画《秦时明月》系列的第一女主角，原型为温世仁原著小说《秦时明月》系列的女主角高月。
燕太子丹之女，原是燕国公主，封号“高月”。天真无邪，温柔婉约，在燕国灭亡后和普通百姓一样过着平常生活，但言谈举止间却仍有一股与生俱来的高贵气质。
原为墨家女弟子，精通药理，是墨家统领端木蓉的得力帮手。没有学过武功，却在阴阳巫术方面也有着非比寻常的天赋。后被阴阳家右护法月神抓走，一度被消去记忆（后期在斗争中逐渐恢复），带入阴阳家，被告知“姓姬，名如，字千泷”，拥有延续千年姬姓最尊贵家族的血脉。之后进入蜃楼，是解开“苍龙七宿”的关键要素之一。 -
荆天明
荆天明，中国动画《秦时明月》系列的第一男主角，原型为小说《秦时明月》系列的男主角荆天明。
父亲是墨家绝顶剑客荆轲，母亲是倾国倾城的丽姬。为人古灵精怪却又有些不知天高地厚，但十分重义气。他迷离的身世牵动整片大地的风云变幻，但自己并不知情。因身世原因而被秦始皇追杀，流落街头。后被“剑圣”盖聂找到，对盖聂十分敬仰，渐生父子之情，跟随盖聂学习剑术。在逃亡的过程中，天明陆续结识了众多江湖高人，并相继与年纪相仿的项少羽、高月、石兰成为好友，也见证了世间最后一片净土墨家机关城的毁灭。机缘巧合之下他成为墨家巨子。磨砺中天明渐渐成长，危难时刻，他甚至挺身而出，凭借自己弱小的肩膀保护着朋友们的性命。然而这一切事件的背后似乎都有着一只看不见的手在操控，江湖神秘势力阴阳家的存在渐渐浮出水面。处于各种斗争漩涡中的天明，由此层层剥开了自己身世以及所有阴谋背后的惊天秘密。 -
绀野美雪
绀野美雪，《穿越时空的少女》中的人物，真琴的妹妹，高中生。
配音演员：关戸优希 麦智钧
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藤谷果穗
藤谷果穗，《穿越时空的少女》中的人物，义工社的学妹，是个个性畏缩不前、常常害羞低着头的女生。对以前参加义工社的功介抱有好感，被两位好朋友拖着向功介告白。
配音演员：谷村美月 郭碧珍
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早川友梨
早川友梨，《穿越时空的少女》中的人物，真琴的同班同学，也是她的好友。喜欢千昭，常透过真琴询问千昭的事情。有点害怕他们俩人是不是正在交往中。最后知道真琴也喜欢千昭，却又鼓励真琴去表白。
配音演员：垣内彩未 黄紫娴
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津田功介
津田功介，《穿越时空的少女》中的人物，绀野真琴的同班同学、一起玩的朋友。有着精悍容貌的秀才型人物。家里是医院，因此也以医生为未来的目标。被学妹告白的事情，是三人间平衡被打破的开始。
配音演员：板仓光隆 卢家炜